国境检疫主体包括自然人和单位。
国境检疫主体是预防传染病由国外传入国内或由国内传出国外的重要措施。
每个国家都按自己的需要规定了需要检疫的病种规定检疫的传染病有鼠疫、霍乱、黄热病以及公布的其他传染病，并在国境处（如国际通航的港口、机场以及陆地入境处和国界江河的口岸）设立国境卫生检疫站，对发病者，可疑病人及密切接触者都要进行隔离或留检。
需要检疫的病种，可根据具体情况而随时调整，如天花原来是各国均要进行检疫的病种，但由于天花已在全世界消灭，故这一病种已无检疫的必要，种痘证明也随之取消。若入境的交通工具来自检疫传染病疫区，被检疫传染病污染，或其中发现能引起传染病的啮齿动物或病媒昆虫时，应进行消毒灭鼠、除虫及其他卫生处理。
【法律法规】
《中华人民共和国国境卫生检疫法》
第四条 入境、出境的人员、交通工具、运输设备以及可能传播检疫传染病的行李、货物、邮包等物品，都应当接受检疫，经国境卫生检疫机关许可，方准入境或者出境。具体办法由本法实施细则规定。第九条 来自国外的船舶、航空器因故停泊、降落在中国境内非口岸地点的时候，船舶、航空器的负责人应当立即向就近的国境卫生检疫机关或者当地卫生行政部门报告。除紧急情况外，未经国境卫生检疫机关或者当地卫生行政部门许可，任何人不准上下船舶、航空器，不准装卸行李、货物、邮包等物品。第十三条 接受入境检疫的交通工具有下列情形之一的，应当实施消毒、除鼠、除虫或者其他卫生处理
（一）来自检疫传染病疫区的；
（二）被检疫传染病污染的；
（三）发现有与人类健康有关的啮齿动物或者病媒昆虫的。
如果外国交通工具的负责人拒绝接受卫生处理，除有特殊情况外，准许该交通工具在国境卫生检疫机关的监督下，立即离开中华人民共和国国境。
