公益拆迁和商业拆迁补偿的不同有：公益拆迁签订的是行政合同，以公共利益需要为目的由地方主导，依据法律规定制订补偿；商业拆迁签订的是民商事合同，以盈利开发为目的由商业人员主导，依据平等自由的原则协商制订补偿。
【法律依据】
《民法典》第二百四十三条
为了公共利益的需要，依照法律规定的权限和程序可以征收集体所有的土地和组织、个人的房屋以及其他不动产。征收集体所有的土地，应当依法及时足额支付土地补偿费、安置补助费以及农村村民住宅、其他地上附着物和青苗等的补偿费用，并安排被征地农民的社会保障费用，保障被征地农民的生活，维护被征地农民的合法权益。征收组织、个人的房屋以及其他不动产，应当依法给予征收补偿，维护被征收人的合法权益；征收个人住宅的，还应当保障被征收人的居住条件。任何组织或者个人不得贪污、挪用、私分、截留、拖欠征收补偿费等费用。
